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Use este identificador para citar ou linkar para este item: https://repositorio.ufpb.br/jspui/handle/123456789/16064
Tipo: TCC
Título: Detecção de ilhas genômicas em procariotos utilizando o método Expectation-Maximization
Autor(es): Monteiro, Tayrone de Sousa
Primeiro Orientador: Rêgo, Thaís Gaudencio do
Resumo: A pesquisa aqui apresentada tem como objetivo utilizar um método de clusterização para a identificação de ilhas genômicas em procariotos. Dessa forma, se baseia em resultados obtidos por outros autores utilizando outras metodologias já conhecidas na literatura, objetivando reproduzir estes resultados com o método de clusterização Expectation-Maximization (EM). Para isso, o método foi implementado em linguagem Java, com auxílio de bibliotecas disponíveis pelo software Weka. Os testes foram realizados utilizando o mesmo conjunto de dados usados por Brito et al. (2016). Os resultados obtidos foram comparados com os de outros métodos presentes na literatura, comprovando a eficácia do EM. Por fim, a análise de algumas ilhas identificadas pelo método proposto, que não foram documentadas anteriormente, foi proposta como trabalho futuro.
Abstract: This research aims to utilize a clustering method for identifying genomic islands in prokaryotes. Based on results already obtained by many authors, the Expectation-Maximization method is applied in order to acquire similar results. The method was implemented in Java language, using libraries available by Weka software. All tests were done considering the same dataset used by Brito et al. (2016).The efficiency of the method could be proved by comparing its results to the others available on the literature. The analysis of some genomic islands that were not identified by the method is suggested as further work.
Palavras-chave: Ilhas genômicas
Expectation-maximization
Cluster
CNPq: CNPQ::ENGENHARIAS
Idioma: por
País: Brasil
Editor: Universidade Federal da Paraíba
Sigla da Instituição: UFPB
Departamento: Sistemas de Computação
Tipo de Acesso: Acesso aberto
Attribution-NoDerivs 3.0 Brazil
URI: http://creativecommons.org/licenses/by-nd/3.0/br/
URI: https://repositorio.ufpb.br/jspui/handle/123456789/16064
Data do documento: 5-Dez-2017
Aparece nas coleções:TCC - Engenharia de Computação

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